Le gameplay est identique à celui de la série. Vous jouez avec le téléphone placé horizontalement, de cette manière celui-ci se transforme en véritable manette classique. Les touches de direction situées sur le côté gauche vous permettent de vous déplacer. Les touches 6, 9, 0 et * sur le côté droit enclenchent diverses actions: la touche 6 active la Parade, la touche 9 la fonction Roulade et 0 permet d'attaquer et d'examiner.
Le "Debugging Mode" prend une place importante dans le jeu. Comme Sora voyage dans une version digitalisée du journal de Jiminy, il rencontre des "bugs" qui apparaissent sous la forme de blocs dispersés sur le terrain. Ceux-ci doivent être détruits si vous voulez approcher les ennemis. Vous pouvez aussi utiliser ces blocs pour résoudre des puzzles et ainsi s'élever aux niveaux supérieurs.