Sora, Donald, Dingo et Jiminy voyagent à travers l'univers dans le vaisseau Gummi quand ils décident d'aller dormir. Ils mettent le vaisseau Gummi sur le pilote automatique et dans leur sommeil, une créature étrange non détectée rampe dans le navire et englobe les rêves de Sora. Quand il se réveille, il est naufragé sur une île déserte appelée l' Île de l'Epéiste, et Donald etDingo sont introuvables. Son but est de trouver ses amis et de quitter l'île, mais même après la recherche dans chaque recoin et fissure de l'île, Sora ne trouve ni Donald ni Dingo , donc il décide de construire un radeau et quitte l'île pour les retrouver.
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